Universitas swasta terbaik di Yogyakarta terdiri dari UMY, Atma Jaya, UKDW, UII, UAD dan USD. Sementara Universitas negeri terbaik di Yogyakarta adalah UGM, UNY dan UIN Sunan Kalijaga.
9 Universitas terbaik di Yogyakarta tersebut didasarkan pada peringkat akreditasi institusi dari Ban-pt yang mendapat akreditasi A, yang dapat dilihat di Universitas terbaik di Indonesia 2018.
9 Universitas terbaik di Yogyakarta tersebut didasarkan pada peringkat akreditasi institusi dari Ban-pt yang mendapat akreditasi A, yang dapat dilihat di Universitas terbaik di Indonesia 2018.